为支撑医学院附庸第一东谈主民病院（上海市第一东谈主民病院）上风重心学科的健康快速发展，聚焦学科重心病种诊治讨论标的九游会J9，拟眩惑、凝合、培养一批高级次、高水平的生命科学与医学讨论畛域的优秀东谈主才，打造一支高水平的专职科学讨论队伍。

我院特点学科稠密、影响力大，包括眼部疾病国度临床医学讨论中心、泌尿外科、骨科、消化科、心内科、普外科、血液科、急诊危重病科、内分泌代谢科、辐照科、临床药学科、麻醉科等，尤其是在眼部神经和血管性疾病、泌尿系统、消化系统肿瘤、血液肿瘤、脓毒血症、代谢性疾病以及影像会诊、免疫和细胞颐养时刻等畛域，亟需高端优秀后生科研东谈主才加盟，聚焦临床疾病诊疗需乞降时刻翻新，与临床团队合作开展具有学术和临床价值的讨论。

一、

东谈主才待遇

1.薪酬：国度级东谈主才Ａ档，年薪135万 + 20万年度奖励；国度级东谈主才Ｂ档，年薪90万 + 12万年度奖励；课题组终年薪60-80万 + 年终绩效；后生课题组终年薪40-65万 + 年终绩效。

2.安家费：国度级东谈主才Ａ档，安家费400-500万；国度级东谈主才Ｂ档，安家费300万；课题组长（外洋引进）安家费100万。

3.启动经费：国度级东谈主才Ａ档，院内启动经费400-600万；国度级东谈主才Ｂ档，院内启动经费250-400万，后生课题组长院内启动经费150万。

4.团队建树：国度级东谈主才Ａ档，建树1-2个团队，每团队4东谈主；国度级东谈主才Ｂ档，建树2-4名责任主谈主员；后生课题组长建树1名责任主谈主员。各级各种东谈主才招收博士后限额不限，薪酬待遇主要由病院支付。

5.其他支握：

5.1提供奇迹单元编制，按照上海市联系计谋办理落户；

5.2为请求东谈主子女处置腹地区最优质入托或就学，全力协助处置妃耦责任；

5.3依称疾院优质医疗资源，提供免费医疗体检与职工就医福利。

6.科研奖励：按照《上海市第一东谈主民病院科技奖励管制条例》章程实施。

二、

配套要求

标配办公地点、实践地点和全球实践智商开荒平台。

三、

彩选尺度

国度级东谈主才Ａ档、Ｂ档走绿色通谈口试、面谈；

课题组长近五年以首要第一作家（名依次一）或首要通信作家（名次临了）在国际顶级学术期刊上发表论著1篇或者其弥留子刊上发表2-3篇，并以首要通信作家（名次临了）发表的SCI收录论著不少于5-8篇；且承担过国度级课题不少于2-3项（外洋引进东谈主才无课题硬性要求）；

后生课题组终年事小于40周岁，近五年以首要第一作家（名依次一）或首要通信作家（名次临了）在国际顶级学术期刊上发表论著1篇或者其弥留子刊上发表1-2篇；且承担国度级课题不少于1项（外洋引进东谈主才无课题硬性要求）；

具备团队合作精神和积极主动对接临床团队、开展临床疾病为导向的转动医学讨论的意愿

四、

应聘材料

个东谈主简历（包括高中起的学习责任资历、科研资历及取得的学术效果）；

代表性论文全文，毕业证、学位证复印件；

拟开展的讨论谋略。

我院长期招聘优秀后生东谈主才，安妥上述要求的应聘者，将应聘材料发送至邮箱honglin.wang@sjtu.edu.cn和shiyirsc@163.com，邮件主题注明“应聘高端东谈主才-姓名”。本招聘告白常年有用，总共材料将严格守秘，不予退还，敬请相识。

上海市第一东谈主民病院临床讨论院诚聘助理讨论员及博士后

（长期有用、随时口试）

一、

助理讨论员招聘要求

1.1 岗亭职责：

在课题组长指挥下孤苦开展科学讨论，承担实践室的泛泛管制以及学生的带教责任，孤苦请求包括国当然后生课题在内的各级各种科研基金并撰写发表学术论文。

1.2 岗亭要求：

（1）获取免疫学、分子生物学、细胞生物学、生死亡学、化学生物学、生物信息学、生物医学工程、材料学、药学、医学等联系专科博士学位；

（2）在国表里获取博士学位不进步三年，品学兼优，身体健康，原则上年事在35周岁以下的非在任东谈主员，应届生、博士后出站优先；

（3）以第一作家（名依次一）发表中科院分区2区及以上SCI论著不少于一篇。

（4）具有较强的英文传奇读写智力，老成阅读英文文件；

（5）醉心生物医学讨论，责任负责严谨，有包袱心，具备孤苦承担课题的智力，邃密的洽商、谐和智力，孤苦责任智力以及团队合作精神；

（6）顺从国度接洽法律功令及上海市第一东谈主民病院的各项轨则轨制。

1.3 岗亭待遇：

（1）提供有竞争力的薪酬待遇，一事一议；

（2）科研奖励按照《上海市第一东谈主民病院科技奖励管制条例》章程实施；

（3）第一聘期内科研获利了得者可晋升为后生PI。

二、

博士后招聘要求

2.1 岗亭要求：

（1）获取博士学位不进步3年，品学兼优，身体健康，年事一般不进步35周岁；

（2）近3年以第一作家发表≥1篇本专科畛域中科院SCI分区2区及以上的论著，或获取国度当然科学基金神志1项。

2.2 岗亭待遇：

（1）享受五险一金；

（2）清晰优秀可优先留院责任；

（3）出站留院后可陈说交大医学院副讨论员职称；

（4）提供有竞争力的薪酬待遇，出站评估优秀予以罕见优越奖励。

2.3 在站时间可请求神志：

在站时间可请求各级各种博士后神志。

三、

各招聘课题组概况如下

应聘材料请发送至 honglin.wang@sjtu.edu.cn 及感兴致课题组课题组长邮箱。

附各课题组详备先容：

一、

王宏林课题组

接洽神志：honglin.wang@sjtu.edu.cn

1.简介:

王宏林 PhD

上海交通大学医学院 讨论员、博士生导师

国度了得后生基金获取者（2017）

科技部重心研发神志首席科学家（2020）

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 临床讨论院 实行副院长

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 疑难疾病精确讨论中心 主任

德国乌尔姆大学医学院 博士、博士后

上海交通大学 特聘训诲

上海交通大学致远荣誉谋略 导师

上海市特聘训诲（东方学者）

上海市浦江东谈主才谋略

上海市优秀学术带头东谈主

中国免疫学会皮肤免疫学分会 副主任委员

中华中医药学会免疫学分会 副主任委员

2.讨论标的：

皮肤免疫学、神经免疫学、药物靶点发现与新药研发

3.原创性科研效果：

3.1 发现RNA病毒感染而非链球菌感染诱发银屑病的发生发展，这是银屑病病因学讨论的弥留阻难，为银屑病的积极注视和颐养提供了全新念念路；

3.2 主握研发出遴荐性扼制Th17细胞分化的自然候选药物小分子，该小分子获取全球自主常识产权（中国、好意思国、欧盟、日本授权发明专利），现已完成I期临床考研与颐养银屑病的IIa期临床考研，行将开展颐养白癜风的II期临床考研。该小分子有望成为我国自主研发、自主常识产权、First-in-Class颐养银屑病、白癜风的国度I类新药；

3.3研发一款检测东谈主体免疫现象的流式细胞学试剂盒，可肤浅、快捷、准确地应用于东谈主体外周血样本。最终的产物在只取1毫升样本、耗时1小时、针对1个主要策划的要求下，准确评估东谈主体“免疫年事与功能”。效果转让总金额6亿元东谈主民币，首期付款3000万元，创上海市医疗机构专利转让首批到账金额最高纪录。

4.近5年代表性文章：

1)Xiangxiao Li, Fengjiao Zhang, Libo Sun, Xiaojie Cai, Fangzhou Lou, Yang Sun, Min Gao, Zhikai Wang, Sibei Tang, Li Fan, Yue Wu, Xinping Jin, Siyu Deng, Zhenyao Xu, Xuxu Sun, Qun Li, Honglin Wang*. scRNA-seq identifies WARS1+ mesenchymal stem cells with enhanced immunomodulatory capacity and improved therapeutic efficacy. Journal of Immunology. 2024 Aug 1;213(3):257-267. doi: 10.4049/jimmunol.2300752.

2)Tang S, Zhang J, Lou F, Zhou H, Wang Z, Sun L, Sun Y, Cai X, Li X, Fan L, Jin X, Deng S, Yin Q, Wang H, Wang H*. LncRNA Dleu2-Encoding Peptide Relieves Autoimmunity by Facilitating Smad3-mediated Regulatory T Cell Induction. EMBO Rep. 2024 Mar;25(3):1208-1232. doi: 10.1038/s44319-024-00070-4. Epub 2024 Jan 30.

3)Lou F, Xu Z, Bai J, Zhao X, Cui L, Li Q, Wang H*. Identification and pre-clinical investigation of CKBA as a drug for external use to treat psoriasis. Br J Pharmacol. 2024;1-18. doi: 10.1111/bph.16253. PMID:37749894.

4)Tong J, Li Y, Cai X, Lou F, Sun Y, Wang Z, Zheng X, Zhou H, Zhang Z, Fang Z,Ding W, Deng S, Xu Z, Niu X, Wang H*. CKBA suppresses mast cell activation viaERK signaling pathway in murine atopic dermatitis. Eur J Immunol. 2023 Sep;53(9):e2350374. doi: 10.1002/eji.202350374. Epub 2023 Jul 7. PMID: 37417726.

5)Cai X, Han M, Lou F, Sun Y, Yin Q, Sun L, Wang Z, Li X, Zhou H, Xu Z, Wang H,Deng S, Zheng X, Zhang T, Li Q, Zhou B, Wang H*. Tenascin C+ papillaryfibroblasts facilitate neuro-immune interaction in a mouse model of psoriasis. Nat Commun. 2023 Apr 10;14(1):2004. doi: 10.1038/s41467-023-37798-x. PMID:37037861; PMCID: PMC10086024.

6)Wang Z, Sun Y, Lou F, Bai J, Zhou H, Cai X, Sun L, Yin Q, Tang S, Wu Y, FanL, Xu Z, Wang H, Hu X, Wang H*. Targeting the transcription factor HES1 byL-menthol restores protein phosphatase 6 in keratinocytes in models ofpsoriasis. Nat Commun. 2022 Dec 19;13(1):7815. doi: 10.1038/s41467-022-35565-y.PMID: 36535970; PMCID: PMC9763329.

7)Zhou H, Lou F, Bai J, Sun Y, Cai W, Sun L, Xu Z, Liu Z, Zhang L, Yin Q, ZhangJ, Gao Y, Wang Z, Niu L, Cai X, Deng S, Wang H, Xia L, Ginhoux F, Li Q, Wang H*. A peptide encoded by pri-miRNA-31 represses autoimmunity by promoting Treg differentiation. EMBO Rep. 2022 May 4;23(5): e53475. doi:10.15252/embr.202153475. Epub 2022 Mar 28. PMID: 35343645; PMCID: PMC9066071.

8)Yin Q, Sun L, Cai X, Lou F, Sun Y, Wang B, Jiang B, Bao L, Li X, Song N, TangS, Bai J, Wang Z, Wu Y, Zhou H, Wang H, Yu B, Li Q, Wang H*. Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication. J Invest Dermatol. 2022Aug;142(8):2173-2183.e6. doi: 10.1016/j.jid.2022.01.002. Epub 2022 Jan 12. PMID:35032503.

9)Chen L, Bai J, Peng D, Gao Y, Cai X, Zhang J, Tang S, Niu L, Sun Y, Lou F, Zhou H, Yin Q, Wang Z, Sun L, Du X, Xu Z, Wang H, Li Q, Wang H*. SZB120 Exhibits Immunomodulatory Effects by Targeting eIF2α to Suppress Th17 Cell Differentiation. J Immunol. 2021 Mar 1;206(5):953-962. doi:10.4049/jimmunol.2000036. Epub 2021 Jan 22. PMID: 33483349; PMCID: PMC7887737.

10)Wei Cai, Junxun Zhang, Hong Zhou, Xiangxiao Li, Fangzhou Lou, Yang Sun, Zhenyao Xu, Jing Bai, Qianqian Yin, Zhikai Wang, Libo Sun, Xiaojie Cai, Sibei Tang, Yue Wu, Li Fan, Hong Wang, Honglin Wang*, Qun Li. Protein phosphatase 6 (Pp6) is crucial for regulatory T cell function and stability in autoimmunity. Genes and diseases. 2021 Aug 17;9(2):562-575. doi: 10.1016/j.gendis.2021.07.005. eCollection 2022 Mar.

11)Niu L, Lou F, Sun Y, Sun L, Cai X, Liu Z, Zhou H, Wang H, Wang Z, Bai J, YinQ, Zhang J, Chen L, Peng D, Xu Z, Gao Y, Tang S, Fan L, Wang H*. A micropeptide encoded by lncRNA MIR155HG suppresses autoimmune inflammation via modulatingantigen presentation. Sci Adv. 2020 May 20;6(21): eaaz2059. doi:10.1126/sciadv. aaz2059. PMID: 32671205; PMCID: PMC7314557.

12)Lou F, Sun Y, Xu Z, Niu L, Wang Z, Deng S, Liu Z, Zhou H, Bai J, Yin Q, CaiX, Sun L, Wang H, Li Q, Wu Z, Chen X, Gu J, Shi YL, Tao W, Ginhoux F, Wang H*. Excessive Polyamine Generation in Keratinocytes Promotes Self-RNA Sensing by Dendritic Cells in Psoriasis. Immunity. 2020 Jul 14;53(1):204-216.e10. doi: 10.1016/j.immuni.2020.06.004. Epub 2020 Jun 17. PMID: 32553276.

13)Danhong Peng, Linjiao Chen, Yang Sun, Libo Sun, Qianqian Yin, Siyu Deng, Liman Niu, Fangzhou Lou, Zhikai Wang, Zhenyao Xu, Conghui Wang, Li Fan, Hong Wang, Honglin Wang*. Melanoma suppression by quercein is correlated with RIG-I and type I interferon signaling. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2020 May:125: 109984. doi: 10.1016/j.biopha.2020.109984. Epub 2020 Feb 25.

5.承担的课题：

团队自2009年组建以来，获取国度当然科学基金了得后生基金、科技部重心研发谋略谋略、国度当然科学基金重心神志、国度当然科学基金首要讨论谋略、国度当然科学基金面上神志等多项资助，总经费逾4200万。

6.授权专利：

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二、

董淑娴课题组

接洽神志：dongshuxian@sjtu.edu.cn

1. 简介:

董淑娴 PhD

上海交通大学医学院 讨论员、博士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度外洋优秀后生科学基金获取者（2021）

科技部重心研发谋略后生神志首席科学家（2021）

上海市浦江东谈主才

好意思国爱因斯坦医学院副讨论员，博士后

好意思国斯隆凯特琳癌症中心博士后

2.讨论标的：

干细胞调控生物学、朽迈

3.原创性科研效果：

3.1 发现了分子伴侣介导的自噬（CMA）在造血干细胞激活及朽迈中的要津调控作用；

3.2 翻新性的构建了展示分子伴侣介导的自噬(CMA)的荧光论述小鼠,并班师分析了CMA活性在体内的时空变化；

3.3 揭示了卵白酶体降解系统和溶酶体降解系统的相互作用，发现卵白酶体激活因子REGγ不错通过调控去乙酰化酶SirT1 而退换巨自噬 (Macro-autophagy) 的开关，从而达到调控肝脏脂肪代谢的看法。

4.近5年代表性文章：

1)Dong S, Wang Q, Kao YR, Diaz A, Tasset I, Kaushik S, Zintiridou A, Nieves E, D’Angelo A, Will B, Cuervo AM. Chaperone-mediated autophagy sustains hematopoietic stem cell function. Nature, 2021, 591(7848): 117-123.

2)Dong S, Aguirre-Hernandez C, Scrivo A, Eliscovich C, Arias E, Bravo-Cordero JJ, Cuervo AM. Monitoring spatiotemporal changes in chaperone-mediated autophagy in vivo. Nature Communication, 2020.

3)Wei, Q., Pinho, S., Dong, S. et al. MAEA is an E3 ubiquitin ligase promoting autophagy and maintenance of haematopoietic stem cells. Nat Commun 12, 2522 (2021).

4)Gomez-Sintes R, Xin Q, Jimenez-Loygorri JI, McCabe M, Diaz A, Garner TP, Cotto-Rios XM, Wu Y, Dong S, Reynolds CA, Patel B, de la Villa P, Macian F, Boya P, Gavathiotis E, Cuervo AM. Targeting NCoR-RARainteraction activates chaperone-mediated autophagy and protects against retinal degeneration. Nat Commun. 2022 Jul 21;13(1):4220.

5)Kaushik S, Juste YR, Lindenau K, Dong S, Macho-González A, Santiago-Fernández O, McCabe M, Singh R, Gavathiotis E, Cuervo AM. Chaperone-mediated autophagy regulates adipocyte differentiation. Sci Adv. 2022 Nov 18;8(46):eabq2733.

6)Shuxian Dong, Britta Will, Ana Maria. Cuervo. Chaperone-mediated autophagy sustains hematopoietic stem cell function. Blood. Volume 134, Issue Supplement_1. November 13 2019

7)Lianlui S, Guangjian F, Peipei S, Xiaoying Q, Shuxian D., et al., Regulation of energy homeostasis by the ubiquitin-independent REGgamma proteasome. Nat Commun, 2016. 7: p. 12497

8)Yarui An, Ying Fu, Danqin Lu, Ya Wang, Wenji Bi, Zhiai Xu, Dong S., Zhang S. , et al., A TiO2-Au-polymer hybrid system for photoelectrochemical immunoassay of SirT1. J. Mater. Chem. B, 2014,2, 1644-1652

9)Dong S., Jia C., Zhang S., Fan G., Li Y., Shan P., Sun L., Xiao W., Li L., Zheng Y., et al., The REGgamma Proteasome Regulates Hepatic Lipid Metabolism through Inhibition of Autophagy. Cell Metab, 2013. 18(3): p. 380-91.

5.承担的课题：

1.2021年度科技部国重心研发后生神志首席科学家：2021YFA1102300，499万

2.2021年度国度外洋优秀后生基金神志，300万

3.2021年度浦江东谈主才（A类）谋略神志：21PJ1412200，30万

4.2023年国度当然科学基金面上神志 82270169，2023.01-2026.12，52万，神志负责东谈主

5.2023年上海市原创探索神志 23ZR1480500，2023.04-2026.03, 50万，神志负责东谈主

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三、

蒋冬生课题组

接洽神志：dongsheng.jiang@shgh.cn

1.简介：

蒋冬生 PhD

上海交通大学医学院 讨论员、博士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度外洋优秀后生科学基金获取者（2021）

上海领军东谈主才外洋后生神志获取者（2021）

新加坡国立大学 学士

新加坡国立大学 博士

德国乌尔姆大学 博士后

德国亥姆霍兹慕尼黑讨论中心，再生生物和医学讨论所 后生PI、副长处

2.讨论标的：

创面愈合与再生、疤痕变成机制与疤痕开发

3.原创性科研效果：

1）从成纤维细胞异质性的角度阐释了疤痕的成因，为注视疤痕的变成提供了全新的颐养念念路（Nat Cell Biol 2018）；

2）修正了疤痕变成的传统不雅念，草创性地揭示了皮下筋膜是疤痕组织的主要起头（Nature 2019）；

3）用活体成像时刻展示疤痕的变成流程和其细胞分子机制，为疤痕讨论提供了一个全新的时空维度视角（Nat Commun 2020）；

4）建立创面和疤痕组织外植体模子和转基因小鼠模子，优化了疤痕机制讨论流程中触及体内、外实践的模子（Nat Commun 2023）。

4.近5年代表性文章：

1) Correa-Gallegos D#, Jiang D#, Christ S, Ramesh P, Ye H, Wannemacher J, Kalgudde Gopal S, Yu Q, Aichler M, Walch A, Mirastschijski U, Volz T, Rinkevich Y. (2019). Patch repair of deep wounds by mobilized fascia. Nature 576(7786): 287-292.

2)Jiang D, Correa-Gallegos D, Christ S, Stefanska A, Liu J, Ramesh P, Rajendran V, De Santis MM, Wagner DE, Rinkevich Y. (2018). Two succeeding fibroblastic lineages drive dermal development and the transition from regeneration to scarring. Nat Cell Biol 20(4): 422-431.

3)Kalgudde Gopal S#, Dai R#, Stefanska AM, Ansari M, Zhao J, Ramesh P, Bagnoli J W, Correa-Gallegos D, Lin Y, Christ S, Angelidis I, Lupperger V, Marr C, Davies LC, Enard W, Machens HG, Schiller HB*, Jiang D*, Rinkevich Y*. (2023). Wound infiltrating adipocytes are not myofibroblasts. Nat Commun 14: 3020.

4)Jiang D, Christ S, Correa-Gallegos D, Ramesh P, Kalgudde Gopal S, Wannemacher J, Mayr CH, Lupperger V, Yu Q, Ye H, Mück-Häusl M, Rajendran V, Wan L, Liu J, Mirastschijski U, Volz T, Marr C, Schiller HB, Rinkevich Y. (2020). Injury triggers fascia fibroblast collective cell migration to drive scar formation through N-cadherin. Nat Commun 11: 5653.

5)Jiang D, Singh K, Muschhammer J, Schatz S, Sindrilaru A, Makrantonaki E, Qi Y, Wlaschek M, Scharffetter-Kochanek K. (2020). MSCs rescue impaired wound healing in a murine LAD1 model by adaptive responses to low TGF-beta1 levels. EMBO Rep 21(4): e49115.

于今60篇SCI论文: https://orcid.org/0000-0003-0961-2671

5.承担的课题：

团队于2023年12月组建，获取国度外洋优秀后生科学基金、上海领军东谈主才（外洋）等神志资助。

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四、

王俊课题组

接洽神志：jwang03@sibs.ac.cn

1.简介

王俊 PhD

上海交通大学医学院 讨论员、博士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度高级次后生东谈主才（2022）

广东省当然科学基金杰青（2021）

中国科学院 博士

好意思国劳伦斯伯克利国度实践室、好意思国肯塔基大学博士后

2.讨论标的

黏膜免疫、黏膜开发、炎癌更正

3.原创性科研效果

3.1 发现感染促进荣达儿肝脏本人免疫性B细胞前体扩增相同胆谈闭锁，好意思罗华可有用开发患儿肝脏免疫稳态（Cell, 2020）。

3.2 发现胞内cAMP浓度缺少是各式儿童炎症性肠病发病的共通机制, 通过使用一种泛PDE扼制剂潘生丁可有用颐养儿童炎症性肠病 （Cell, 2019）。讨论效果获取2019年中国医学首要进展。

4.近5年代表性文章 (#第一作家；*通信作家)

1)JunWang#, YanhuiXu#, ZhanghuaChen#, JiankunLiang#, ZefengLin#, HuiyingLiang#, YipingXu, QiWu, XuanjieGuo, JunliNie, BingtaiLu, BingHuang, HuifangXian, XiaohuiWang, QiangWu, JixiaoZeng, ChengweiChai, MeixueZhang, YuzhenLin, LiZhang, ShanmeiziZhao, YanluTong, XiaoqiongGu, LiangZeng, Zhuang-guiChen,ShuhongYi, TongZhang, DavidDelfouneso, YanZhang, StephenLNutt, AndrewMLew, LiweiLu, FanBai*, HuiminXia*, ZheWen*andYuxiaZhang*. Liverimmuneprofilingrevealspathogenesisandtherapeuticsforbiliaryatresia.Cell, 2020, 187(7):1867-1883.

2)BingHuang# , ZhanghuaChen# , LanlanGeng#, JunWang#, HuiyingLiang#, YujiaCao, HuanChen, WanmingHuang, MeilingSu, HanqingWang, YanhuiXu, YukunLiu, LuB, HuifangXian, HuiwenLi, HuilinLi, LuRen, JingXie, LipingYe, HongliWang, JunhongZhao, PeiyuChen, LiZhang, ShanmeiziZhaoS, TingZhang, BanglaoXu, DiChe, WenyueSi, XiaoqiongGu, LiangZeng , YongWang , DingyouLi, YifanZhan, DavidDelfouneso, AndrewM. Lew, JunCui, WaiHo. Tang, YanZhang, SitangGong*, FanBai*, MinYang*, YuxiaZhang*. MucosalProfilingofPediatric-OnsetColitisandIBDRevealsCommonPathogenicsandTherapeuticPathways. Cell, 2019;179(5):1160-1176.

3)HuahuaXu, GuihongPan, JunWang*. Repairingmechanismsfordistalairwayinjuriesandrelatedtargetedtherapeuticsforchroniclungdiseases. CellTransplantation, 2023, 32:1-16.

4)BingtaiLu#, MingLiu#, JunWang#, HuifengFan#, DiyuanYang, LiZhang, XiaoqiongGu, JunliNie, ZhenjunChen, AlexandraJ. Corbett, MichaelJ. Zhan, ShengboZhang, VanessaL. Bryant, AndrewM. Lew, JamesMcCluskey, Hai-binLuo, JunCui, YuxiaZhang*, YifanZhan*, GenLu*. IL-17 productionbytissue-residentMAITcellsislocallyinducedinchildrenwithpneumonia. MucosalImmunol., 2020; 13(5):824-835.

5)DalongSun, JingChen, LongziLiu, GuangxiZhao, PingpingDong, BingruiWu, JunWang*, LingDong*. Establishmentofa 12-geneexpressionsignaturetopredictcoloncancerprognosis. PeerJ, 2018, 6:e4942.

5.承担的课题

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五、

王义平课题组

接洽神志：yiping.wang1@shgh.cn

1.简介:

王义平 PhD

上海交通大学医学院 副讨论员

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度优秀后生科学基金获取者（2023）

复旦大学 博士

哈佛大学/麻省总病院 博士后

中国科协后生东谈主才托举工程

上海市后生科技启明星

2.讨论标的：

细胞代谢与东谈主类疾病

3.原创性科研效果：

3.1 肿瘤细胞感知代谢物调控线粒体生物发生以保管能量稳态；

3.2 线粒体代谢重塑调控细胞应激和表不雅遗传促进肿瘤发生发展；

4.近5年代表性文章：

1)Weiwei Yan#, Chengmei Xie#, Sijun Sun#, Quan Zheng#, Jingyi Wang, Zihao Wang, Cheuk-Him Man, Haiyan Wang, Yunfan Yang, Tianshi Wang, Leilei Shi, Shengjie Zhang*, Chen Huang*, Shuangnian Xu*, Yi-Ping Wang*.SUCLG1 restricts POLRMT succinylation to enhance mitochondrial biogenesis and leukemia progression. EMBO Jounal, 2024 已领受

2)Yi-Ping Wang, Azeem Sharda, Shuang-Nian Xu, Nick van Gastel, Cheuk Him Man, Una Choi, Wei Zhong Leong, Xi Li, David T Scadden*. Malic enzyme 2 connects the Krebs cycle intermediate fumarate to mitochondrial biogenesis. Cell Metab. 2021 May 4;33(5):1027-1041.e8

3)Wei-Wei Yan, Yun-Liu Liang, Qi-Xiang Zhang, Di Wang, Ming-Zhu Lei, Jia Qu, Xiang-Huo He, Qun-Ying Lei, Yi-Ping Wang*. Arginine methylation of SIRT7 couples glucose sensing with mitochondria biogenesis. EMBO Reports. 2018 Dec;19(12). pii: e46377

4)Xing-Yu Zhong, Xiu-Ming Yuan, Ying-Ying Xu, Miao Yin, Wei-Wei Yan, Shao-Wu Zou, Li-Ming Wei, Hao-Jie Lu, Yi-Ping Wang*, Qun-Ying Lei*. CARM1 Methylates GAPDH to Regulate Glucose Metabolism and Is Suppressed in Liver Cancer. Cell Reports. 2018 Sep 18;24(12):3207-3223

5)Yi-Ping Wang*, Jin-Tao Li, Jia Qu, Miao Yin, Qun-Ying Lei*. Metabolite sensing and signaling in cancer. J Biol Chem. 2020 Aug 14;295(33):11938-11946

5.承担的课题：

团队自2023年组建以来，获取国度当然科学基金优秀后生基金、国度当然科学基金面上神志、科技部重心研发谋略、上海市当然科学基金等多项资助，总经费逾700万。

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六、

卢鹏飞课题组

接洽神志：pengfei.lu@sjtu.edu.cn

（本课题组同期招聘时刻员，慑服请接洽课题组长）

1.简介:

卢鹏飞 PhD

上海交通大学医学院 讨论员、博士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度外洋优秀后生科学基金获取者

上海市领军东谈主才（外洋）

上海市浦江东谈主才

好意思国爱因斯坦医学院 副讨论员

好意思国爱因斯坦医学院 博士后

中科院上海生化细胞所 博士

山东大学 学士

2.讨论标的：

心血管发育与疾病

3.原创性科研效果：

3.1 揭示冠状血管发育与再生开发机制，为的防治提供表面基础；

3.2 进展先天性二叶式主动脉瓣的致病机理，并收场宫内发育无理改良，为先天性疾病的注视和颐养提供了全新念念路；

3.3 发现心肌细胞异质性，为腹黑心肌挫伤开发颐养奠定基础。

4.近5年代表性文章：

1)Pengfei Lu*, Yidong Wang*, Yang Liu, Yifeng Wang, Bingruo Wu, Deyou Zheng, Richard P Harvey, Bin Zhou. Perinatal angiogenesis from pre-existing coronary vessels via DLL4-NOTCH1 signalling. Nature Cell Biology. 2021 Sep;23(9):967-977. (* Co-first author)

2)Pengfei Lu#, Bingruo Wu, Yidong Wang, Megan Russell, Yang Liu, Daniel J Bernard, Deyou Zheng, Bin Zhou#. Prerequisite endocardial-mesenchymal transition for murine cardiac trabecular angiogenesis. Developmental Cell. 2023 May 8; 58, 791-805. (# Co-corresponding author)

3)Pengfei Lu, Bingruo Wu, Xuhui Feng, Wei Cheng, Richard N Kitsis, Bin Zhou. Cardiac Myosin Heavy Chain Reporter Mice to Study Heart Development and Disease. Circulation Research. 2022 Aug 5;131(4):364-366.

4)Pengfei Lu*, Ping Wang*, Bingruo Wu, Yidong Wang, Yang Liu, Wei Cheng, Xuhui Feng, Xinchun Yuan, Miriam M Atteya, Haleigh Ferro, Yukiko Sugi, Grant Rydquist, Mahdi Esmaily, Jonathan T Butcher, Ching-Pin Chang, Jack Lenz, Deyou Zheng, Bin Zhou. A SOX17-PDGFB Signaling Axis Regulates Aortic Root Development. Nature Communications. 2022 Jul 13;13(1):4065. (* Co-first author)

5)Pengfei Lu#, Bingruo Wu, Yidong Wang, Jingran Zhang, Bin Zhou#. A sandwiched ventricular explant assay to model mouse coronary angiogenesis ex vivo. STAR Protocols. 2023 Oct 27;4(4):102619. (# Co-corresponding author)

6)Yidong Wang*, Pengfei Lu*, Bingruo Wu, Bernice E Morrow, Bin Zhou. NOTCH maintains developmental cardiac gene network through WNT5A. Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 2018 Dec;125:98-105. (* Co-first author)

7)Huahua Liu*, Pengfei Lu*, Shan He, Yuru Luo, Yuan Fang, Sonia Benkaci, Bingruo Wu, Yidong Wang, Bin Zhou. β-Catenin regulates endocardial cushion growth by suppressing p21. Life Science Alliance. 2023 Jun 29;6(9):e202302163. (* Co-first author)

5.承担的课题：

团队自2023年组建以来，获取中组部、国度当然科学基金、上海市等科研神志资助。

1. 中组部，外洋优青，2024-2026，在研，主握

2. 国度当然科学基金委员会，面上神志，2024-2027，在研，主握。

3. 上海市委组织部，领军东谈主才谋略（外洋），2023-2026，在研，主握

4. 上海市科委，浦江东谈主才谋略，2023-2025，在研，主握

5. 上海市第一东谈主民病院，启动经费，2023-2027，在研，主握

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七、

陈念念念念课题组

接洽神志：sisichen@shsmu.edu.cn

1.简介:

陈念念念念 PhD

上海交通大学医学院 讨论员、博士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度外洋优秀后生科学基金获取者

上海市领军东谈主才（外洋）

上海市浦江东谈主才

牵记斯隆-凯特琳癌症中心 博士后

哈佛大学医学院 博士后

好意思国印第安纳大学医学院 博士

2.讨论标的：

造血干细胞与血液肿瘤

3.原创性科研效果：

3.1 弥留基因突更变控造血干细胞自我更新以及克隆性造血的分子机制

3.2 驱动朽迈联系的克隆性造血发生的弥留内源和外源要素

3.3 血液肿瘤发生的机制及靶向策略

4.近5年代表性文章：

1)Chen S#, Vedula RS#, Navarro AC#, Lu B, Hogg SJ, Wang E, Benbarche S, Knorr K, Kim WJ, Stanley RF, Cho H, Erickson C, Singer M, Cui D, Tittley S, Durham BH, Pavletich T, Fiala E, Walsh MF, Inoue D, Monette S, Taylor J, Rosen N, McCormick F, Lindsley RC, Castel P, Abdel-Wahab O. Impaired proteolysis of non-canonical RAS proteins drives clonal hematopoietic transformation. Cancer Discovery. 2022 Jul 29;12(10):2434-2453. doi:10.1158/2159-8290.CD-21-1631.

2)North K#, Benbarche S#, Liu B, Pangallo J, Chen S, Stahl M, Bewersdorf JP, Stanley RF, Erickson C, Cho H, Pineda JMB, Thomas JD, Polaski JT, Belleville AE, Gabel AM, Udy DB, Humbert O, Kiem HP, Abdel-Wahab O, Bradley RK. Synthetic introns enable splicing factor mutation-dependent targeting of cancer cells. Nature Biotechnology. 2022 Jul;40(7):1103-1113. doi: 10.1038/s41587-022-01224-2.

3)Chen S, Abdel-Wahab O. Splicing regulation in hematopoiesis. Current Opinion in Hematology. 2021 Jul 1;28(4):277-283. doi: 10.1097/MOH.0000000000000661.

4)Chen S, Benbarche S, Abdel-Wahab O. Splicing factor mutations in hematologic malignancies. Blood. 2021 Jun;138(8):599-612. doi:10.1182/blood.2019004260.

5)Inoue D#, Polaski JT#, Taylor J#, Castel P, Chen S, Kobayashi S, Hogg SJ, Hayashi Y, Pineda JMB, El Marabti E, Erickson C, Knorr K, Fukumoto M, Yamazaki H, Tanaka A, Fukui C, Lu SX, Durham BH, Liu B, Wang E, Mehta S, Zakheim D, Garippa R, Penson A, Chew GL, McCormick F, Bradley RK, Abdel-Wahab O. Minor intron retention drives clonal hematopoietic disorders and diverse cancer predisposition. Nature Genetics. 2021 May;53(5):707-718. doi: 10.1038/ s41588-021-00828-9.

6)Chen S, Yu H, Gao R, Nabinger SC, Kobayashi M, Yao C, Liu SZ, Yoder MC, Kapur R, Broxmeyer HE, Gao Z, and Liu Y. Mutant p53 Drives Clonal Hematopoiesis through Modulating Epigenetic Pathway. Nature Communications. 2019 Dec 11;10(1):5649. doi: 10.1038/ s41467-019-13542-2.

7)Chen S and Liu Y. p53 involvement in clonal hematopoiesis of indeterminate potential. Current Opinion in Hematology. 2019 Jul;26(4):235-240. doi:10.1097/MOH.0000000000000509.

8)Chen S, Gao R, Yao C, Kobayashi M, Liu SZ, Yoder MC, Broxmeyer HE, Kapur R, Boswell HS, Mayo LD, and Liu Y. Genotoxic stresses promote the clonal expansion of hematopoietic stem cells expressing mutant p53. Leukemia. 2018 Mar;32(3):850-854. doi:10.1038/leu.2017.325.

9)Cai Z, Kotzin JJ, Ramdas B, Chen S, Nelanuthala S, Palam LR, Pandey R, Mali RS, Liu Y, Kelley MR, Sandusky G, Mohseni M, Williams A, Henao-Mejia J, Kapur R. Inhibition of Inflammatory Signaling in Tet2 Mutant Preleukemic Cells Mitigates Stress-Induced Abnormalities and Clonal Hematopoiesis. Cell Stem Cell. 2018 Dec 6;23(6):833-849.e5. doi:10.1016/j.stem.2018.10.013.

5.承担的课题：

课题组自2023年组建以来，获取中组部、上海市等东谈主才神志资助。

1.国度外洋优秀后生科学基金，中组部，2024-2026，在研，主握。

2.上海市领军东谈主才（外洋），上海市委组织部，2024-2026，在研，主握。

3.上海市白玉兰东谈主才谋略浦江神志，上海市科委，2023-2025，在研，主握。

4.上海市第一东谈主民病院启动经费，2023-2027，在研，主握。

5.Leukemia & Lymphoma Society Career Development Award, 2021-2024，在研，主握。

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八、

周鲁明课题组

接洽神志：l.zhou13@imperial.ac.uk

lumingzhou86@gmail.com

1.简介:

周鲁明 PhD

上海交通大学医学院 讨论员

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

国度外洋优秀后生科学基金获取者

上海市领军东谈主才谋略

英国伦敦帝国理工学院医学院 博士后

德国图宾根大学医学院Hertie讨论所 博士

2.讨论标的：

神经挫伤与开发、神经免疫学、朽迈神经生物学

3.原创性科研效果：

3.1 发现CXCL13依赖性CD8+ T细胞与背根神经节（DRG）神经元交互在老年小鼠坐骨神经再生败落中的弥留作用，并应用CXCL13特异性抗体颐养权臣提高了坐骨神经的再生与功能开发，填补了干豫技能逆转朽迈导致神经再生退化的空缺；

3.2 在神经内源性再盼愿制方面，进展了在DRG神经元再生流程中说明弥留作用的组卵白乙酰化与代谢调控机制。

4.近5年代表性文章：

1)Zhou, L., Kong, G., Palmisano, I., Cencioni, M.T., Danzi, M., De Virgiliis, F., Chadwick, J.S., Crawford, G., Yu, Z., and De Winter, F. (2022). Reversible CD8 T cell–neuron cross-talk causes aging-dependent neuronal regenerative decline. Science 376, eabd5926.

2)Serger, E., Luengo-Gutierrez, L., Chadwick, J.S., Kong, G., Zhou, L., Crawford, G., Danzi, M.C., Myridakis, A., Brandis, A., and Bello, A.T. (2022). The gut metabolite indole-3 propionate promotes nerve regeneration and repair. Nature 607, 585-592.

3)Müller, F. *, De Virgiliis, F. *, Kong, G. *, Zhou, L. *, Serger, E., Chadwick, J., Sanchez-Vassopoulos, A., Singh, A.K., Eswaramoorthy, M., and Kundu, T.K. (2022). CBP/p300 activation promotes axon growth, sprouting, and synaptic plasticity in chronic experimental spinal cord injury with severe disability. PLoS biology 20, e3001310. (*co-first author)

4)Kong, G.*, Zhou, L.*, Serger, E., Palmisano, I., De Virgiliis, F., Hutson, T.H., Mclachlan, E., Freiwald, A., La Montanara, P., and Shkura, K., Puttagunta R., Di Giovanni S. (2020). AMPK controls the axonal regenerative ability of dorsal root ganglia sensory neurons after spinal cord injury. Nature Metabolism 2, 918-933. (*co-first author).

5)De Virgiliis, F., Hutson, T.H., Palmisano, I., Amachree, S., Miao, J., Zhou, L., Todorova, R., Thompson, R., Danzi, M.C., and Lemmon, V.P. (2020). Enriched conditioning expands the regenerative ability of sensory neurons after spinal cord injury via neuronal intrinsic redox signaling. Nature Communications 11, 1-16.

6)Hervera, A.*, Zhou, L.*, Palmisano, I., McLachlan, E., Kong, G., Hutson, T.H., Danzi, M.C., Lemmon, V.P., Bixby, J.L., Matamoros‐Angles, A., Forsberg K., De Virgiliis F., Matheos D.P., Kwapis J., Wood M.A., Puttagunta R., Del Rio Ja., Di Giovanni S. (2019). PP4‐dependent HDAC3 dephosphorylation discriminates between axonal regeneration and regenerative failure. The EMBO journal 38. (*co-first author).

7)De Virgiliis, F., Hutson, T.H., Palmisano, I., Amachree, S., Miao, J., Zhou, L., Todorova, R., Thompson, R., Danzi, M.C., and Lemmon, V.P., Bixby J.L., Wittig I., Shah A.M., Di Giovanni S. (2020). Enriched conditioning expands the regenerative ability of sensory neurons after spinal cord injury via neuronal intrinsic redox signaling. Nature Communications 11, 1-16.

8)Palmisano, I., Danzi, M.C., Hutson, T.H., Zhou, L., McLachlan, E., Serger, E., Shkura, K., Srivastava, P.K., Hervera, A., and O’Neill, N., Liu T., Dhrif H., Wang Z., Kubat M., Wuchty S., Merkenschlager M., Levi L., Elliott E., Bixby J.L., Lemmon V.P., Di Giovanni S. (2019). Epigenomic signatures underpin the axonal regenerative ability of dorsal root ganglia sensory neurons. Nature Neuroscience 22, 1913-1924.

9)Hutson, T.H., Kathe, C., Palmisano, I., Bartholdi, K., Hervera, A., De Virgiliis, F., McLachlan, E., Zhou, L., Kong, G., and Barraud, Q., Danzi M.C., Medrano-Fernandez A., Lopez-Atalaya J.P., Boutillier A.L., Sinha S.H., Singh A.K., Chaturbedy P., Moon L.D.F., Kundu T.K., Bixby J.L., Lemmon V.P., Barco A., Courtine G., Di Giovanni S. (2019). Cbp-dependent histone acetylation mediates axon regeneration induced by environmental enrichment in rodent spinal cord injury models. Science Translational Medicine 11, eaaw2064.

10)Hervera, A., De Virgiliis, F., Palmisano, I., Zhou, L., Tantardini, E., Kong, G., Hutson, T., Danzi, M.C., Perry, R.B.-T., and Santos, C.X., Kapustin A.N., Fleck R.A., Del Rio J.A., Carroll T., Lemmon V.P., Bixby J.L., Shah A.M., Fainzilber M., Di Giovanni S. (2018). Reactive oxygen species regulate axonal regeneration through the release of exosomal NADPH oxidase 2 complexes into injured axons. Nature Cell Biology 20, 307-319.

5.承担的课题：

团队瞻望于2024年头端庄组建开动。当今获取国度当然科学基金面上神志1项。

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九、

孔德平课题组

接洽神志：deping.kong@shsmu.edu.cn

1.简介:

孔德平 PhD

上海交通大学医学院 副讨论员、硕士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

上海市后生科技启明星（2021）

中国科学院大学 博士

天津医科大学 博士后

中国生理学会轮回委员会 委员

中国药理学会心血管药理委员会 后生委员

2.讨论标的：

血管免疫学、血管代谢生物学

3.科研效果：

3.1 归拢非激素类消炎药NSAID临床应用中存在的心血管问题，认知COX-2下流脂质代谢产物前方腺素D2在炎症与心血管稳态的联系讨论。对合理使用NSAID提供了表面依据，也为筛选抗心血管疾病的第三代NSAID提供了潜在靶点。

3.2 聚焦代谢性炎症与血管稳态的基础医学与临床转动讨论，围绕代谢和免疫在病理现象下相互作用的调控收集，从RNA万般性层面挖掘血管重构的异质性新靶点。

4.代表性文章：

1)Kong D*#, Liu J#, Lu J#, Chen H, Duan Z, Ke Yu, Zheng X, Zou P, Zhou L, Zeng C, Lv Y, Zeng Q, Lu L, Li L, He Y*. HMGB2 Release Promotes Pulmonary Hypertension and Predicts Severity and Mortality of Patients with Pulmonary Arterial Hypertension. Arterioscler Thromb Vasc Biol. doi: 10.1161/ATVBAHA.123.319916. (2024)

2)Wu H, Lu Y, Duan Z, Wu J, Lin M, Wu Y, Han S, Li T, Fan Y, Hu X, Xiao H, Feng J, Lu Z*, Kong D*, Li S*. Nanopore long-read RNA sequencing reveals functional alternative splicing variants in human vascular smooth muscle cells. Commun Biol. 6(1):1104. (2023 )

3)Kong D#*; YuY* ; Prostaglandin D2 signaling and cardiovascular homeostasis, J Mol Cell Cardiol,167: 97-105(2022)

4)Kong D#, Wan Q#, Li J, et al, Yu Y*. DP1 activation reverses age-related hypertension via NEDD4L-mediated T-bet degradation in T Cells. Circulation. 141(8):655-666 (2020)

5)He Y#, Zuo C#, Jia D#, Bai P#, Kong D#, Chen D#, Liu G, et al, Wang J*, Lyu A*, Shen Y*, Yu Y*. Loss of DP1 aggravates vascular remodeling in pulmonary arterial hypertension via mTORC1 signaling. Am J Respir Crit Care Med. doi: 10.1164/rccm.201911-2137OC. (2020)

6)Li J#, Kong D#, Wang Q#, Wu W#, Tang Y, et al, Wang L*, Yu Y*. Niacin ameliorates ulcerative colitis by activation of D prostanoid receptor 1. EMBO Mol Med. 9(5):571-588 (2017)

7)Kong D, Li J, Shen Y, et al, Yu Y*. Niacin promotes cardiac healing after myocardial infarction through activation of myeloid Prostaglandin D2 receptor subtype 1. J Pharmacol Exp Ther. 360:435-444 (2017).

8)Kong D, Shen Y, Zuo S, et al, Yu Y*. PKA regulatory IIa subunit is essential for PGD2-mediated resolution of inflammation. J Exp Med. 213:2209-26 (2016).

5.承担的课题：

团队自2020年组建以来，获取获取病院启动经费、国度当然科学基金面上基金、专项基金和上海市科委神志等多项资助。

1）糖酵解醛缩酶ALDOA相当乳酰化修饰调控肺动脉高压中血管重塑的作用和机制讨论(国度当然科学基金委员会, 专项神志, 82241018, 2023.01 - 2025.12, 50万元);

2）NEDD4L下调介导的IRS4积蓄在心肌梗死中的作用及机制讨论 (国度当然科学基金委员会, 面上神志, 82170253, 2022.01-2025.12, 58万元);

3）E3泛素连气儿酶NEDD4L在心肌梗死中的作用及机制讨论 (上海市科学时刻委员会, 上海市当然科学基金原创探索类神志, 21ZR1481200, 2021.07-2024.06, 50万元)。

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十、

李班师课题组

接洽神志：shengli.li@sjtu.edu.cn

1.简介:

李班师 PhD

上海交通大学医学院 副讨论员、硕士生导师

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

上海市后生科技启明星

上海市领军东谈主才（外洋）

好意思国德州大学休斯顿健康科学中心 博士后

复旦大学 博士

中国生物工程学管帐算生物学与生物信息学专委会 委员

中国生物信息学会（筹）首要疾病组学信息学专委会 委员

2.讨论标的：

计较生物学与生物信息学、卵白质翻译及调控、肿瘤发生与精确医疗

3.原创性科研效果：

3.1 认知了肿瘤RNA转录本图谱，识别了多数未谛视的RNA转录本（如AC092803-u1）,构建了RNA归拢卵白-转录本-抗肿瘤药物关系收集（如PTBP1-KIAA1522-a6-Decitabine）,并识别了癌症类型特异的RNA象征物；

3.2 冷漠了基于卵白质组的胃食管归拢部肿瘤的三种分子分型，并识别了不同分子亚型特异的潜在药物靶点。

4.近5年代表性文章：

1)Hu W, Wu Y, Shi Q, Wu J, Kong D, Wu X, He X, Liu T, Li S*. Systematic characterization of cancer transcriptome at transcript resolution. Nat Commun. 2022 Nov 10;13(1):6803. PMID:36357395.

2)Shi Q, Liu T, Hu W, Chen Z, He X, Li S*. SRTdb: an omnibus for human tissue and cancer-specific RNA transcripts. Biomark Res. 2022 Apr 26;10(1):27. PMID: 35473935.

3)Wu H, Lu Y, Duan Z, Wu J, Lin M, Wu Y, Han S, Li T, Fan Y, Hu X, Xiao H, Feng J, Lu Z, Kong D, Li S*. Nanopore long-read RNA sequencing reveals functional alternative splicing variants in human vascular smooth muscle cells. Commun Biol. 2023 Oct 31;6(1):1104. PMID: 37907652

4)Li S, Yuan L, Xu Z, Xu J, Chen G, Guan X, Pan G, Hu C, Dong J, Du Y, Yang L, Ni M, Jiang R, Zhu X, Lv H, Xu H, Zhang S, Qin J, Cheng X. Integrative proteomic characterization of adenocarcinoma of esophagogastric junction. Nat Commun. 2023 Feb 11;14(1):778. PMID: 36774361.

5)Li S, Hu Z, Zhao Y, Huang S, He X. Transcriptome-wide analysis reveals the landscape of aberrant alternative splicing events in liver cancer. Hepatology. 2019 Jan;69(1):359-375.

6)Li S, Li Y, Chen B, Zhao J, Yu S, Tang Y, Zheng Q, Li Y, Wang P, He X, Huang S. exoRBase: a database of circRNA, lncRNA and mRNA in human blood exosomes. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D106-D112. PMID: 30053265.

7)Li S, Zhang J, Huang S, He X. Genome-wide analysis reveals that exon methylation facilitates its selective usage in the human transcriptome. Brief Bioinform. 2018 Sep 28;19(5):754-764. PMID: 28334074.

8)Feng J, Wu H, Li S*. Noncanonical translation of circRNAs drive antitumor immunity. Trends Cancer. 2024 Jan 18:S2405-8033(24)00006-2. PMID: 38242823.

9)Liu Y, Hu W, Xie Y, Tang J, Ma H, Li J, Nie J, Wang Y, Gao Y, Cheng C, Li C, Ma Y, Su S, Zhang Z, Bao Y, Ren Y, Wang X, Sun F, Li S*, Lu R. Single-cell transcriptomics enable the characterization of local extension in retinoblastoma. Commun Biol. 2024 Jan3;7(1):11. PMID: 38172218.

10)Wu Y, Xu M, Feng Z, Wu H, Wu J, Ha X, Wu Y, Chen S, Xu F, Wen H, Li S*, Wu X. AUF1-induced circular RNA hsa_circ_0010467 promotes platinum resistance of ovarian cancer through miR-637/LIF/STAT3 axis. Cell Mol Life Sci. 2023 Aug 17;80(9):256. PMID: 37589744.

11)Li C, Wu H, Guo L, Liu D, Yang S, Li S*, Hua K. Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and molecular stratification of cervical cancer. Commun Biol. 2022 Nov 10;5(1):1208. PMID: 36357663.

12)Zhang J, Li S#, Zhang L, Xu J, Song M, Shao T, Huang Z, Li Y. RBP EIF2S2 promotes tumorigenesis and progression by regulating MYC-mediated inhibition via FHIT-related enhancers. Mol Ther. 2020 Apr 8;28(4):1105-1118. PMID: 32059763.

13)Zhang J, Li S#, Zhang J. Docetaxel resistance-derived LINC01085 contributes to the immunotherapy of hormone-independent prostate cancer by activating the STING/MAVS signaling pathway. Cancer Lett. 2022 Oct 1:545:215829. PMID: 35868534.

14)Shen M, Li S#, Zhao Y, Liu Y, Liu Z, Huan L, Qiao Y, Wang L, Han L, Chen Z, He X. Hepatic ARID3A facilitates liver cancer malignancy by cooperating with CEP131 to regulate an embryonic stem cell-like gene signature. Cell Death Dis. 2022 Aug 25;13(8):732. PMID: 36008383.

15)Chen Z, Li S#, Shen M, Lu X, Bao C, Chen D, Ding J, Wang Q, Huang S, Cong W, Han L, He X. The Mutational and transcriptional landscape of hepatocarcinogenesis in a rat model. iScience. 2020 Oct 15;23(11):101690. PMID: 33163943.

16)Xu J, Wang Z, Li S#, Chen J, Zhang J, Jiang C, Zhao Z, Li J, Li Y, Li X. Combinatorial epigenetic regulation of non-coding RNAs has profound effects on oncogenic pathways in breast cancer subtypes. Brief Bioinform. 2018 Jan 1;19(1):52-64. PMID: 27742663.

17)Ruan H, Xiang Y, Ko J, Li S#, Jing Y, Zhu X, Ye Y, Zhang Z, Mills T, Feng J, Liu C, Jing J, Cao J, Zhou B, Wang L, Zhou Y, Lin C, Guo A, Chen X, Diao L, Li W, Chen Z, He X, Mills G, Blackburn M, Han L. Comprehensive characterizationof circular RNAs in ~1000 human cancer cell lines. Genome Med. 2019 Aug 26;11(1):55. PMID: 311446897.

5.承担的课题：

6.软件文章权：

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十一、

林达课题组

接洽神志：da.lin@shgh.cn

1.简介

林达 PhD

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI

第三届博士后翻新东谈主才支握谋略（2018）

2.讨论标的：

肿瘤基因组学、三维基因组学、单细胞组学

3.原创性讨论效果

3.1 开发了一系列新式染色质空间构象拿获及基因组结构变异检测时刻，其中包括针对多数细胞的DLO Hi-C（Nature Genetics，2018），针对微量细胞的DLO Hi-C 2.0（JGG，2020），针对单细胞的sciDLO Hi-C（Nature Communications，2022）。Nature Genetics挑升发表驳斥文章，对DLO Hi-C规律予以较高评价。

3.2 应用DLO Hi-C系列时刻，认知了巨噬细胞分化及免疫活化流程中染色质空间构象重塑和表不雅修饰重编程，拓展了疾病易感基因，发掘了新的药物颐养靶点，寻找到了新的潜在颐养药物。

3.3 基于肿瘤基因组三维结构特征，开发了多重基因组结构非常及ecDNA检测规律MGA-Seq，并绘画了肾癌组织中ecDNA互作收集（Genome Biology，2023）。

4.近5年代表性文章：

1)Da Lin#, Ping Hong#, Siheng Zhang, Weize Xu, Muhammad Jamal, Keji Yan, Yingying Lei, Liang Li, Yijun Ruan, Zhen F. Fu, Guoliang Li*, Gang Cao*, Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture, Nature Genetics, 2018, 50(5): 754-763. (5-year IF: 39.321) (亮点文章，Nature genetics同期驳斥文章专题报谈)。

2)Da Lin*#, Yanyan Zou#, Xinyu Li, Jinyue Wang, Qin Xiao, Xiaochen Gao, Fei Lin, Ningyuan Zhang, Ming Jiao, Yu Guo, Zhaowei Teng, Shiyi Li, Yongchang Wei, Fuling Zhou, Rong Yin, Siheng Zhang, Lingyu Xing, Weize Xu, Xiaofeng Wu, Bing Yang, Ke Xiao, Chengchao Wu, Yingfeng Tao, Xiaoqing Yang, Jing Zhang, Sheng Hu, Shuang Dong, Xiaoyu Li, Shengwei Ye, Zhidan Hong, Yihang Pan, Yuqin Yang, Haixiang Sun*, Gang Cao*, MGA-seq: robust identification of extrachromosomal DNA and genetic variants using multiple genetic abnormality sequencing, 2023, Genome Biology. (5-year IF: 17.4)

3)Da Lin#, Weize Xu#, Ping Hong#, Chengchao Wu, Zhihui Zhang, Siheng Zhang, Lingyu Xing, Bing Yang, Wei Zhou, Qin Xiao, Jinyue Wang, Cong Wang, Yu He, Xi Chen, Xiaojian Cao, Jiangwei Man, Aikebaier Reheman, Xiaofeng Wu, Xingjie Hao, Zhe Hu, Chunli Chen, Zimeng Cao, Rong Yin, Zhen F. Fu, Rong Zhou, Zhaowei Teng, Guoliang Li*, Gang Cao*, Decoding the Spatial Chromatin Organization and Dynamic Epigenetic Landscapes of Macrophage Cells During Differentiation and Immune Activation, Nature Communications, 2022 Oct 4;13(1):5857. (5-year IF: 17.763)

4)Zhihui Zhang, Chengchao Wu, Khaista Rahman, Weize Xu, Guoliang Li*, Da Lin*, Gang Cao*, Robust capturing chromosome conformation using the DLO Hi-C 2.0 method, Journal of Genetics and Genomics, 2020, 47(10): 655-658.

5)Da Lin, Siheng Zhang, Zhihui Zhang, Weize Xu, Ping Hong, Guoliang Li, Gang Cao, The \"toolbox\" for chromatin conformation capture (in Chinese), SCIENTIA SINICA Vitae, 2020, 50(5): 497-505.

5.承担的课题

先后主握国当然面上神志（2024）、国当然后生神志（2019）、博士后翻新东谈主才支握谋略（2018）、博士后一等面上资助（2018）等基金神志多项。

6.授权专利：

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十二、

施雷雷课题组

接洽神志：leilei.shi@shgh.cn

1. 简介:

施雷雷 PhD

上海交通大学医学院附庸第一东谈主民病院 课题组长、PI、博士生导师

上海市浦江东谈主才

2.讨论标的：

生物活性光敏剂、多肽水凝胶材料

3. 原创性科研效果：

3.1 分子靶向光敏剂。本团队阻难传统光敏剂在应用流程中遭遇的瓶颈问题，举例O2含量、解放基取销以及激光光源等的限度，先后开发了四代光敏剂，尤其是最新一代的自觉光分子靶向光敏剂大约在低氧现象下，通过病灶部位特殊生理生化特征的刺激下大约驱动光敏剂自觉光产生氧解放基；

3.2 生物大分子药物透皮寄递。皮肤角质层的障蔽作用使得药物透皮速度和浸透量难以餍足颐养的需求，是开发透皮给药制剂的首要防碍，尤其是大分子生物药类。针对生物大分子透皮寄递畛域的贫乏，讨论团队通过多数的筛选，想象出了具备高透皮性能的新式多肽水凝胶材料，可高效透皮寄递功能核酸、功能卵白等生物大分子药物。

4.近5年代表性文章：

1)Leilei Shi, Peng Zhang, Xiaoxiao Liu, Yuzhen Li, Wenbo Wu, Xihui Gao*, and Bin Liu*. “An Activity-Based Photosensitizer to Reverse Hypoxia and Oxidative Resistance for Tumor Photodynamic Eradication” Advanced Materials, 34 (2022), 202206659. (IF: 32.086, 1区)

2)Leilei Shi, Xiaoxiao Liu, Yuzhen Li, Sha Li, Wenbo Wu, Xihui Gao*, and Bin Liu*. “Living Bacteria-Based Immuno-Photodynamic Therapy: Metabolic Labeling of Clostridium Butyricum for Eradicating Malignant Melanoma” Advanced Science, 9 (2022), e2105807. (IF: 17.521, 1区)

3)Leilei Shi, Wenbo Wu, Yukun Duan, Li Xu, Sha Li, Xihui Gao*, and Bin Liu*. “Carrier-Free Hybrid DNA Nanoparticles for Light-induced Self-Delivery of Functional Nucleic Acid Enzymes” ACS Nano, 15 (2021), 1841-1849. (IF: 18.027, 1区)

4)Leilei Shi, Wenbo Wu, Yukun Duan, Li Xu, Yingying Xu, Lidan Hou, Xiangjun Meng, Xinyuan Zhu, and Bin Liu*. “Light Induced Self-Escape of Spherical Nucleic Acid from Endo/Lysosome for Efficient Non-Cationic Gene Delivery” Angew. Chem. Int. Ed., 59 (2020), 19168-19174. (IF: 16.823, 1区)

5)Leilei Shi, Fang Hu, Yukun Duan, Wenbo Wu, Jinqiao Dong, Xiangjun Meng, Xinyuan Zhu, Bin Liu*. “Hybrid Nanospheres to Overcome Hypoxia and Intrinsic Oxidative Resistance for Enhanced Photodynamic Therapy.” ACS Nano, 14 (2020), 2183-2190. (IF: 18.027, 1区)

6)Lianfeng Fan, Chuanjiang Jian, Ling Li, Li Wang, Xuejiao Song, Minjia Wang, Chutong Liu, Xiaoxiao Liu, Shidang Xu, Xihui Gao*, Xianjie Shi, Miaomiao Yuan*, Bin Liu*, Leilei Shi*, “A Bioactive Photosensitizer for Hypoxia-Tolerant Molecular Targeting-Photo-Immunotherapy of Malignant Tumor”, Advanced Functional Materials, 2023, 202313755. (IF:19.0, 1区)

7)Yu T...